路甬祥说：建设改革创新和谐奋进中国科学院，是中科院发展理念与发展目标上的新的提升与发展。是中科院党组站在时代和历史的高度，因应国际国内环境的变化和国家发展的战略需要，及时应对出现的新挑战，敏锐把握发展的新机遇，所提出的重大战略任务，做出的重要决策，是中科院贯彻落实科学发展观、构建社会主义和谐社会重大战略任务的具体体现，是实现中科院创新跨越持续发展的迫切要求。建设改革创新和谐奋进中国科学院6个方面的目标任务是一个有机统一的整体，缺一不可，其中“布局合理”是前提和基础，“四个一流”是出发点和落脚点，“和谐有序”既是目标也是保证，“竞争向上”是基本要求，“开放合作”是必由之路，“引领发展”是重要责任。“改革创新和谐奋进”是对中科院“三个基地”、“四个一流”发展目标的继承和发展，是中科院发展理念与发展目标上的新的提升与发展，使中科院未来发展图景更加清晰、完整和鼓舞人心，将极大地激励全院职工奋发努力，实现中科院更好更快地发展。
在谈到对促进创新友好型社会建设的思考时，路甬祥说：我们要建设的创新友好型社会，应当是自主创新能力不断提升的社会。我们要建设的创新友好型社会，应当是国家创新体系高效运行的社会。我们要建设的创新友好型社会，应当是拥有创新友好市场的社会。建设创新友好型社会也是全面贯彻落实科学发展观、构建社会主义和谐社会的必然要求，也对中科院发展提出了新课题，我们应当在建设改革创新和谐奋进中国科学院的过程中，深入思考，积极探索，在建设创新友好型社会中积极发挥引领和带动作用。
在谈到中科院要牢固树立引领发展的理念时，路甬祥说：作为国家战略科技力量，中科院要牢固树立引领发展的理念，率先实现科技创新的跨越发展，使我国科学技术真正走在前面，有效支撑创新型国家和社会主义和谐社会建设，成为引领中国经济社会发展的主导力量。中科院要率先实现跨越，引领我国经济社会发展。要科学谋划未来，为我国和中科院的长远发展奠定基础。要推动科学传播，实现科技创新活动的科学人文效益。
在谈到遵循规律深化改革时，路甬祥说：要深刻认识科学发展观，以科学发展观指导中科院科技创新工作。要深刻认识科技创新的动力，科学规划和奋力有效推进中科院科技创新工作。要深刻认识人才成长的规律，建设一支结构合理、充满活力的创新队伍。要从人才成长规律出发，坚持以人为本，坚持党管人才，坚持德才兼备的人才观，坚持优秀科技人才的价值标准。要深刻认识竞争合作发展的规律，坚持竞争择优加快发展。
路甬祥重点谈了科技界广泛关注的科技评价问题。他说：从国际科技评价发展的趋势看，科技评价已从传统的单一产出评价，拓展到科技规划、科技投入、组织实施、科技产出及其后效等科技活动各个环节，更加强调及人评价。创新三期乃至更长的一个时期，中科院要着力构建明确导向、有效激励、分类评价、分级管理的评估体系，开展分层次、有重点的科技评价工作，一是支撑院战略管理的科技评价，其重点是院发展态势分析、科技布局评估、规划与政策执行评估、科技创新基地评估等。
二是促进研究所竞争发展的科技评价，其重点是研究所综合质量评估、研究所创新能力监测、研究所投入产出分析等。三是体现院政策导向的专项科技评价，其重点是项目评估、人才评估、实验室评估及其他政策导向评估等。从而，形成我院基于院所两级体制、体现和谐理念、激励竞争合作与创新发展、多信号反馈的科技评估模式。
对大力加强作风建设问题，路甬祥强调了要端正科学理念和规范科研行为。他说：崇高的理念、科学的精神才能导致崇高的创新行为，导致杰出的科技创新成就和对人类社会的卓越贡献。当前社会上实际存在的浮躁之风和科学不端行为，追根溯源都是由于科学价值、科学精神的曲解和缺失，导致道德准则和社会责任的失落。当代科学技术渗透并影响人类社会生活的方方面面，要求科学工作者必须更加自觉地规范科学行为，遵守人类社会的基本伦理，珍惜与尊重自然和生命，尊重人的价值和尊严，规避科学技术的负面影响，并努力为公众理解科学作出贡献。最近，中科院在广泛深入调研和征求意见的基础上，认真研究国内外有关制度、办法、规定，结合中科院实际，制定了《中国科学院关于加强科研行为规范建设的意见》。这对于保持我院良好的科研秩序和学风，保证科研工作的科<