方新副书记在报告中指出，社会和谐是中国特色社会主义的本质属性，是国家富强、民族振兴、人民幸福的重要保证，是我们党不懈奋斗的目标，是全党全国各族人民的共同愿望。建设社会主义和谐社会是党中央审时度势确定的重大战略任务。和谐社会，包含三个层面的和谐，即人与自然、人与人、身与心的协调和统一。建设和谐社会必须坚持以人为本，必须坚持科学发展，必须坚持改革开放，必须坚持民主法治，必须坚持正确处理改革、发展、稳定的关系，必须坚持在党的领导下全社会共同建设。
关于建设和谐研究所，方新副书记说，对于我们以知识分子为主的研究所，代表群众根本利益的重点是要给职工创造发展的机会，在发展中使得每个人都能人尽其才，实现自己的价值。发展才有凝聚力，发展才是硬道理。基础研究、战略高技术和经济社会可持续发展相关研究是我院科技创新工作的三个主要方面，既相互联系，又各具特点。各个创新基地，都要从面向国家战略需求、世界科技发展前沿和区域经济社会发展需求中，提出科学和技术问题，凝练和提升科技创新的目标。
方新副书记认为要建设和谐研究所，必须处理好各类人才群体的关系，建设和谐奋进的创新群体，是我院改革发展的关键。我院知识创新工程进展顺利，业绩令人鼓舞，成就催人振奋。但我们应当清醒地看到，我们面临的机遇前所未有，面临的挑战也前所未有。因此，研究所要加强战略管理，凝练科技目标；居安思危，打造核心竞争力；全面协调可持续发展，加强人才队伍建设，加强平台和能力建设；加强创新文化建设，加强党建和领导班子建设。